หากคุณใช้เครื่องกรองน้ำที่ติดตั้งต่างหากสำหรับการดื่มน้ำโดยเฉพาะ คุณไม่จำเป็นที่จะต้องกังวลเกี่ยวกับกระบอกใส่ไส้กรองน้ำ แต่หากคุณติดตั้งเครื่องกรองน้ำไว้ใต้อ่างล้างจานที่บ้าน คุณควรทำความสะอาดตัวกระบอกใส่ไส้กรองน้ำเป็นประจำ กระบอกใส่ไส้กรองน้ำนั้นช่วยให้ไส้กรองตั้งอยู่กับที่ ซึ่งเป็นวัสดุที่ทำจากพลาสติกจึงสามารถทำความสะอาดได้ง่าย คุณควรอ่านคำแนะนำในการถอดกระบอกใส่ไส้กรองน้ำในการทำความสะอาด วิธีการทำความสะอาดเครื่องกรองน้ำที่ดีที่สุดคือการล้างด้วยน้ำสะอาดเพียงอย่างเดียว การใช้สบู่หรือน้ำยาทำความสะอาดชนิดอื่นๆสามารถส่งผลกระทบไปถึงกลิ่นและรสชาติของน้ำดื่มได้ การทำความสะอาดที่กรองน้ำอาจทำให้คุณเกิดความสับสนได้ เพราะคุณจะต้องใช้น้ำสะอาดในการทำความสะอาดเครื่องกรอง แต่น้ำที่สะอาดนั้นจะต้องถูกกรองมาจากเครื่องกรอง ดังนั้น คุณจึงควรวางแผนในการทำความสะอาดเครื่องกรองน้ำให้ดีเสียก่อนล่วงหน้า โดยการกักเก็บน้ำสะอาดที่ได้รับการกรองเรียบร้อยแล้ว เพื่อใช้ในการทำความสะอาดเครื่องกรองและเทคนิคในการทำความสะอาดเครื่องกรองง่ายๆ คือการกรอกน้ำสะอาดล้างเพื่อขจัดสิ่งสกปรกและสารเคมีต่างๆให้หลุดออก
การเปลี่ยนไส้กรองน้ำนั้นจำเป็นที่จะต้องเปลี่ยนอยู่บ่อยครั้งเพื่อให้แน่ใจว่าน้ำที่กรองนั้นสะอาดอยู่เสมอ การเปลี่ยนไส้กรองนั้นง่ายกว่าที่คุณคิดคุณสามารถใช้คู่มือการใช้เครื่องกรองน้ำเพื่อช่วยในการการเปลี่ยนไส้กรอง การเปลี่ยนไส้กรองน้ำนั้นจะต้องเปลี่ยนบ่อยแค่ไหนขึ้นอยู่กับชนิดของไส้กรองที่คุณเลือก ซึ่งปกติแล้วไส้กรองที่มีราคาแพงกว่านั้นจะมีอายุการใช้งานที่ยาวนานกว่าและตามหลักทั่วไปแล้ว ไส้กรองน้ำควรเปลี่ยนทุกๆ 3-6 เดือน คุณควรระวังในการเลือกใช้ผลิตภัณฑ์ทำความสะอาด หากคุณไม่อยากให้น้ำดื่มของคุณมีรสชาติที่ผิดเพี้ยน คุณสามารถใช้สบู่ที่มีความอ่อนโยนในการทำความสะอาดวัสดุอื่นๆ ภายในเครื่องกรองน้ำ ประกอบกับการอ่านคู่มือการทำความสะอาดเครื่องกรองน้ำของคุณเพื่อความปลอดภัยในการทำความสะอาด คุณควรเปลี่ยนไส้กรองน้ำทุกๆ 3-6 เดือน เพื่อคุณภาพในการใช้งานที่ดีที่สุด